Ympäristömerkintä hallinnoi Suomessa sekä pohjoismaista ympäristömerkkiä Joutsenmerkkiä että EU-ympäristömerkkiä. Ympäristömerkinnän asiantuntijat osallistuvat kriteerien laadintaan, käsittelevät hakemuksia ja valvovat merkin luvanhaltijoita. Ympäristömerkinnän tehtäviin kuuluu myös merkkien viestintä ja markkinointi.
Ympäristömerkintä on Motiva Services Oy:n alainen yksikkö. Toiminta saa valtiontukea, mutta suurin osa liikevaihdosta tulee lupatuloista. Ympäristömerkintätyötä Suomessa ohjaa työ- ja elinkeinoministeriön ja ympäristöministeriön koolle kutsuma Ympäristömerkintälautakunta. Tutustu myös Joutsenmerkin pohjoismaiseen organisaatioon.